世人对萦绕着这幅世界最著名肖像画的种种谜团十分好奇，人们很容易将此归咎于作家丹·布朗和他的畅销小说以及后来的那部电影《达芬奇密码》。那部小说设想了画家画作中解开这些时代谜团的各种线索。但事实上在丹·布朗出版他的这本虚构小说之前，《蒙娜丽莎》就是人们仔细研究的对象，500年以来，学者们一直试图找到围绕这幅杰作产生的种种问题的答案。

最近，研究人员从意大利一家女修道院里挖掘出丽莎·盖拉蒂妮的疑似遗骸，并正对其进行检测，希望能确定遗骸的身份，很多人都认为丽莎·盖拉蒂妮就是画中人物的原型。这一项目旨在挖掘丽莎· 盖拉蒂妮的遗骸并利用头盖骨对其面部进行复原。参与者称这个项目将能进一步证实他们对蒙娜丽莎真实身份的猜想—她是佛罗伦萨一位丝绸商人的妻子。DNA分析结果最早可能于6月份得出。

关于蒙娜丽莎的身份，现在仍是众说纷纭。在达芬奇生活的时代，有关这幅肖像画模特的身份，另有十几种说法。其中之一认为这幅肖像所画的是这位受人尊敬的艺术家的男助手(还有一些说法认为可能是情人)吉安·贾科莫·卡普罗蒂·达奥伦诺，也就是人们更为熟知的萨莱1。其他研究人员甚至猜想这幅画事实上是画家的自画像。